저는 보통 가상머신에 리눅스를 설치하여 putty 를 이용해 코딩을 합니다.
merge tool meld 를 사용합니다.
sudo apt install meld
putty 에서 머지를 하면 윈도우 에서 meld 가 실행되게 합니다.
윈도우에서 X Program 을 사용하기 위한 xming 을 설치하고
https://sourceforge.net/projects/xming/
putty 에서 Enable X11 forwarding 을 체크
이제 putty 에서 meld 를 실행하면 윈도우 환경에서 meld 가 실행됩니다.